Cung cấp sức mạnh cho Doogee S98 Pro là chip Mediatek Helio G96 (12 nm) lõi 8 với xung nhịp tối đa 2,05 GHz, GPU Mali-G57 MC2. RAM 8 GB đi kèm bộ nhớ trong 128 GB, có khay cắm thẻ microSD với dung lượng tối đa 512 GB. Hệ điều hành Android 12.

Ngoại hình của Doogee S98 Pro khá góc cạnh và hầm hố. Kích thước của máy lần lượt là 172x82x15,5 mm, trọng lượng 320 g. Cảm biến vân tay của máy được tích hợp nơi nút nguồn bên cạnh phải.

Dung lượng pin của Doogee S98 Pro ở mức 6.000 mAh, tích hợp sạc nhanh có dây 33W, sạc nhanh không dây 15W. Theo nhà sản xuất, viên pin này cho thời gian sử dụng bình thường 2-3 ngày, chơi game hoặc xem video 10 giờ, đàm thoại 28 giờ hoặc thời gian chờ 18 ngày.

Doogee S98 Pro cho khả năng kháng bụi, kháng nước theo tiêu chuẩn IP68 (có thể ngâm nước ở độ sâu 1,5 m trong 30 phút). Đồng thời, nó còn đạt chuẩn độ bền quân sự Mỹ MIL-STD-810H giúp nó có thể thả rơi từ 1,5 m xuống nền bê tông. Tiêu chuẩn IP69K giúp nó hoạt động ở môi trường khắc nghiệt, áp lực nước cao.

Màn hình chính của Doogee S98 Pro sử dụng tấm nền IPS LCD kích cỡ 6,3 inch, độ phân giải Full HD Plus (2.340x1.080 pixel) cho mật độ điểm ảnh 409 ppi. Màn hình này chia theo tỷ lệ 19:9, bảo vệ bởi kính cường lực Corning Gorilla Glass nhưng chưa rõ loại nào, có thể thao tác khi bị ướt, mang găng tay.

Doogee S98 Pro được trang bị 2 camera sau. Trong đó, cảm biến chính độ phân giải 48 MP, khẩu độ f/1.8 cho khả năng lấy nét theo pha. Ống kính quan sát ban đêm 20 MP, f/1.8 cùng 2 cảm biến hồng ngoại giúp quan sát ban đêm. S98 Pro hỗ trợ quay video 2K. Máy ảnh selfie 16 MP, f/2.0.